Moleküler alerji testi bu test konusunda eğitimli olan Alerji Uzmanlarınca değerlendirilmelidir. Bu testin değerlendirilmesi çok zor ve çok bilgi gerektiren bir testtir. Moleküler alerji testi ile sadece neye alerjiniz olduğu saptanmaz. Aynı zamanda alerjenlerin içindeki moleküller de analiz edilmektedir. Her alerjen içinde birçok molekül olması ve her birinin öneminin de ayrı olmasından dolayı moleküler testin değerlendirilmesinde eğitim çok önemlidir.
Testin sonucunda çıkan değerlerin ne anlama geldiğini, gerçek alerjiler ile çapraz reaksiyonları ayırabilecek bilgiye sahip olan alerji uzmanlarınca yorumlanması gereken bir testtir. Testin yorumlanması bilinmediği taktirde bu testin yapılmasının da hiçbir anlamı yoktur.